DSFQ. Mòdul 3. Pràctica 3. Internet i la física i química a secundària


	L'enllaç químic. El plug-in Chime

	A la xarxa podeu trobar la representació en tres dimensions (3D) de moltes molècules. Malauradament, sovint aquestes representacions s'han dissenyat amb diferents programes diferents i, en conseqüència, es necessita instal·lar connectors, plugins o programes per visualitzar-les. L'objectiu d'aquesta pràctica és descarregar, instal·lar i provar el plug-in Chime, un dels més utilitzats a Internet per visualitzar representacions en 3D de molècules.

	Desenvolupament de la pràctica


	Abans de començar la pràctica heu de tenir present que: En aquesta pràctica heu d'instal·lar a l'ordinador un programa aliè al Departament d'Educació i Universitats. El fabricant pot canviar el mètode de descàrrega i la instal·lació totalment o parcialment en qualsevol moment, i les instruccions poden no coincidir exactament amb les descrites en aquest manual. En descarregar i instal·lar aquest programa al vostre sistema informàtic, assumiu qualsevol risc dels danys que s'hi puguin produir. En cas de dubte, parleu amb el vostre tutor/a del curs.
	1. Alta al web d'Elseviers MDL. Instal·lació del plug-in Chime

	NOTA: Al llarg d'aquesta pràctica suposem que esteu utilitzant algun sistema operatiu de Microsoft. En cas d'utilitzar Macintosh, el procediment serà molt semblant. En el moment d'escriure aquesta pàgina no hi ha versions per a altres sistemes operatius.
	El Chime és un dels visors moleculars més utilitzats al web. És molt senzill de descarregar i instal·lar. Tot i ser de descàrrega gratuïta (per finalitats educatives) cal donar-se d'alta. En primer lloc, aneu a la pàgina de registre d'Elseviers MDL: http://www.mdl.com/my_account/register1.jsp Pàgina de registre de la web d'Elseviers MDL
	Cal omplir obligatòriament els camps indicats amb l'asterisc. És molt important que indiqueu una adreça de correu electrònic correcta, ja que rebreu la constrasenya (password). El nom amb el qual us identificareu (user name) el podeu escollir lliurement. Un cop omplert i enviat el formulari, rebreu a la bústia del correu electrònic la constrasenya per connectar-vos al web d'Elseviers MDL.

	2. Descàrrega del plug-in Chime

	Ara ja podeu connectar-nos al web d'Elseviers com a usuaris registrats. Aneu a la pàgina d'entrada: http://www.mdl.com/index.jsp Introduïu-hi el vostre User Name i la contrasenya enviada per correu electrònic:
	Pàgina d'inici d'Elseviers MDL
	Aneu a la secció de descàrregues (Downloads) i escolliu Download products: Anireu a parar aquí: Escolliu del menú desplegable MDL® Chime i apareixeran les darreres versions d'aquest producte. En el moment de redactar aquesta pàgina era MDL® Chime 2.6 SP6 for Windows. Per últim, a la pantalla següent, premeu el botó per iniciar la descàrrega (Start Download): Podeu escollir entre instal·lar l'arxiu al moment o desar-lo al disc per instal·lar-lo posteriorment:

	Avís per a usuàries i usuaris del navegador Firefox El programa d'instal·lació no detecta la presència a l'ordinador d'aquest navegador (i, per tant, posteriorment no el podreu utilitzar per visualitzar molècules). Malgrat això, podeu "enganyar-lo" simulant que teniu instal·lat un navegador Netscape 4.x. El procediment es descriu a la pàgina: http://plugindoc.mozdev.org/faqs/nonn4.html Però, si voleu, podeu executar directament l'arxiu: http://downloads.mozdev.org/plugindoc/Fake4x/fake4x.xpi Cal que, prèviament, autoritzeu el lloc plugindoc.mozdev.org per instal·lar programes al vostre ordinador (cal anar a Eines/Opcions/Continguts i prémer el botó Excepcions:


	3. Instal·lació del plug-in Chime

	En començar la instal·lació, en executar l'arxiu acabat de descarregar, apareixerà la pantalla següent: Premeu el botó retolat Next > i apareixerà la típica pantalla en la qual s'han d'acceptar els termes de la llicència del programa: Si hi esteu d'acord, premeu Yes. Aneu seguint les diverses pantalles i quan us demani el nom i la companyia, podeu introduir el nom real o un d'inventat. A la pantalla on es demana el mètode per trobar els navegadors instal·lats al vostre ordinador, us recomanem que escolliu la primera opció: Deixa que el programa d'instal·lació cerqui al registre del Windows els navegadors instal·lats: Premeu el botó Next >. Apareixerà la pantalla amb els navegadors detectats (el Firefox el detectarà com a Netscape Communicator si heu seguit les instruccions per a usuaris del Firefox indicades més amunt). Premeu el botó i, a la pantalla següent, deixeu que registri automàticament els tipus de fitxers associats. Ja podeu donar la instal·lació per acabada. Ja la podeu provar.

	4. Proves i utilització del plug-in Chime

	Per tal de comprovar el funcionament del Chime, connecteu-vos a la pàgina: http://www.deciencias.net/simulaciones/quimica/comprobar.htm Veureu a la dreta una imatge de la molècula d'aigua. Fent clic amb el botó esquerre sobre la molècula i arrossegant-la, observareu com gira. A la mateixa web, a la pàgina: http://www.deciencias.net/simulaciones/quimica/ trobareu més exemples a l'apartat on diu Química del carbono. Però si voleu veure tota la potència del plug-in en acció, podeu carregar pàgines com: http://www.nyu.edu/pages/mathmol/library/ i entrar a qualsevol de les pàgines. Amb el plug-in Chime podeu veure les molècules en format pdb (al final d'aquesta pàgina trobareu informació per visualitzar les molècules amb un visor de realitat virtual). Per exemple, si aneu a: http://www.nyu.edu/pages/mathmol/library/hydrocarbons/pentane.pdb us apareixerà una imatge semblant a aquesta: Cliqueu a sobre de la imatge amb el botó dret del ratolí per veure les opcions disponibles. Per exemple, escolliu Display/Ball&Stick: Ara veureu la molècula de pentà així: Amb el Chime es poden visualitzar molècules tan complexes com l'hemoglobina: http://www2.ufp.pt/~pedros/anim/2frame-hben.htm

	Informació complementària
	Altres enllaços a recursos per treballar el tema de l'enllaç i la formulació

	Enllaç químic en Flash: http://www.chem.iastate.edu/group/Greenbowe/sections/projectfolder/flashfiles/ reaction/bonding1.html Activitats clic sobre el tema de l'enllaç (en castellà): http://clic.xtec.net/db/act_es.jsp?id=2023 Molècules en 3D (en castellà): http://www.educaplus.org/modules/wfsection/article.php?articleid=30 Pàgina de la IUPAC: http://www.chem.qmul.ac.uk/iupac/index.html Activitats clic sobre formulació inorgànica (ESO-batxillerat): http://clic.xtec.net/db/act_ca.jsp?id=3141

	Altres visors moleculars

	Una altra manera de visualitzar molècules de forma interactiva és amb un visor VRML de realitat virtual com ara el client Cortona VRML que podeu instal·lar gratuïtament des de la pàgina de l'empresa: http://www.parallelgraphics.com/products/cortona/ Si aneu a la pàgina: http://www.nyu.edu/pages/mathmol/library/hydrocarbons/pentane.wrl visualitzareu una imatge semblant a aquesta: Experimenteu amb els diversos controls i arrossegueu amb el botó esquerre del ratolí. Altres pàgines utilitzen el Jmol, que no és més que un applet del Java i que, per tant, no necessita cap instal·lació addicional a la realitzada a la pràctica 2 del mòdul 1: http://jmol.sourceforge.net/ Permet determinar angles d'enllaç i distàncies entre àtoms. Hi ha una base de dades amb informació de milers de molècules que n'inclou la visualització amb el Jmol: http://www.chemexper.com/ A la caixa de text només heu d'entrar el nom en anglès o la fórmula i prémer el botó Search. Per exemple, escriviu H2O i premeu Search. Feu clic sobre Water i, a continuació, a la dreta, on diu 3D model, feu clic sobre Show. Si tot ha anat bé, us apareixerà la imatge següent: Proveu-la (cliqueu-hi a sobre amb el botó dret). Altres pàgines amb informació sobre visors moleculars: Una altra pàgina força interessant amb molècules per visualitzar és Molecule on the Month: http://www.chm.bris.ac.uk/motm/motm.htm La pàgina d'ajuda sobre visors moleculars de la web Molecule on the Month: http://www.chm.bris.ac.uk/motm/whatneed.htm La pàgina de la companya Carmen Fernández, professora de l'IES Salvador Dalí del Prat de Llobregat : http://www.xtec.cat/~cfernand/visors.htm

Altres visors moleculars