En determinades màquines pot ser d'interès limitar l'accés de root per SSH, d'aquesta manera es posa una dificultat afegida a possibles accessos a l'ordinador, aquesta qüestió serà d'especial interès per aquelles màquines que són connectades a Internet (p.e. els servidors WEB).
Cal editar l'arxiu /etc/ssh/sshd_config i modificar el paràmetre PermitRootLogin que es troba, aproximadament a la línia 26 de l'arxiu
PermitRootLogin yes
PermitRootLogin no